ファクタリングの費用はいくら？手数料の内訳・相場・実質コストと安く抑えるポイント

ファクタリングを検討するときに一番気になるのが「結局いくらかかるのか」「銀行融資より高いのか」という点ではないでしょうか。本記事では、ファクタリングの費用を〈手数料・登記費用・各種事務コスト〉に分解し、2社間・3社間ごとの相場と計算イメージ、年率換算で見た実質コストの考え方を整理します。さらに、見積書でチェックすべきポイントや高コスト・偽装ファクタリングを避けるチェックリスト、銀行融資との費用比較まで客観的に解説し、自社にとって無理のない費用水準を判断しやすくすることを目的としています。

ファクタリング費用の仕組み

ファクタリングの「費用」というと、まず思い浮かぶのは手数料率ですが、実際にはそれ以外にもいくつかのコストが積み上がって総額になります。

基本構造としては、①売掛金額面に対する手数料（◯％）、②契約・審査にかかる事務手数料、③債権譲渡登記や司法書士報酬などの実費、④振込手数料や出張費など個別対応の費用、といった項目が代表的です。

これらが「いつ発生するのか」「何に対する割合なのか」を理解しておかないと、見積りを見ても実際にいくら手元に残るのかが分かりづらくなってしまいます。

また、費用の発生タイミングも重要です。多くのケースでは、ファクタリング会社から利用者へ入金される際に、手数料や事務手数料が差し引かれた金額が振り込まれますが、債権譲渡登記に関する費用や司法書士報酬などは、別途請求書で精算される場合もあります。

入金額だけを見て「思っていたより少ない」と感じるケースは、「見積書のどの項目が差し引かれた結果なのか」が整理できていないことが原因になっていることが少なくありません。

ファクタリング費用を正しく把握するためには、「請求書額」「手数料率」「前倒し日数」の3点に加えて、「その他の諸費用」がどう設定されているかを一覧で確認することが大切です。

ファクタリング費用の内訳と発生タイミング

ファクタリング費用の中心となるのは「手数料（買取手数料）」ですが、実務上はそれ以外の費用も含めて「総費用」として把握する必要があります。

典型的な内訳は、①請求書額に対する手数料率（例：3〜20％）、②契約・審査に伴う事務手数料（数万円〜）、③債権譲渡登記にかかる登録免許税・司法書士報酬、④振込手数料や出張費等の細かな諸費用です。

これらが「どの時点で」「どのように差し引かれるか」を確認しておかないと、最終的な手取り額が予想とずれる原因になります。

発生タイミングとしては、手数料と事務手数料は多くの会社で「入金時に差し引き」という形が一般的です。

つまり、請求書額1,000万円、手数料率5％、事務手数料5万円という条件であれば、入金時に50万円＋5万円が差し引かれ、実際の入金額は945万円となるイメージです。

登記関連費用は、別途請求として後日振込になる場合と、あらかじめ見積りに組み込んでまとめて差し引く場合があり、会社によって運用が異なります。

また、売掛先や案件によっては、通常より高めの手数料や追加の調査費用が必要とされることもあるため、見積書や契約書では「標準条件だけでなく、例外条件」がどのように書かれているかも確認が必要です。

2社間・3社間で異なる手数料の考え方

ファクタリング費用を考えるうえで避けて通れないのが、「2社間ファクタリング」と「3社間ファクタリング」の違いです。

2社間ファクタリングは、利用者（売掛債権の保有者）とファクタリング会社の間だけで契約を完結させ、売掛先には債権譲渡の事実を通知しないスキームです。

一方、3社間ファクタリングは、売掛先にも債権譲渡を通知し、売掛先からファクタリング会社へ直接支払ってもらう形を取ります。

一般的に、2社間は売掛先に知られずに利用できる反面、ファクタリング会社にとっては「売掛先からの入金が一度利用者を経由する」「売掛金をほぼ利用者の信用で回収する」構造になりやすいため、リスクが高く、その分手数料率が高めに設定される傾向があります。

これに対し、3社間は売掛先が直接ファクタリング会社に支払うため、回収リスクが相対的に低くなり、手数料率も抑えやすいと言われています。

費用比較の際には、「2社間だから高い／3社間だから安い」と単純に決めつけるのではなく、「自社が重視するのはコストか秘匿性か」「売掛先との関係性から通知が可能か」を踏まえて検討することが重要です。

また、3社間の場合でも、登記費用や書類のやり取りなど追加の手間・コストが発生するケースがあるため、手数料率だけでなく、トータルの費用と実務負担のバランスを見て判断する必要があります。

ファクタリング費用と金利の違い

ファクタリング費用は「手数料率◯％」と表示されるのに対し、銀行融資などの借入は「金利◯％（年率）」と表示されるため、数字だけを見るとファクタリングの方が高く見えやすくなります。

ここで重要なのは、「金利」と「手数料」の性質の違いを整理したうえで、実質コストを比較することです。

金利は、借入残高に対して時間の経過に応じて発生する費用（利息）であり、返済期間や返済方法によって総額が変わります。

一方、ファクタリングの手数料は、売掛金の額面に対して一括で差し引かれる性質のもので、「前倒しした期間分のコスト」をまとめて支払うイメージです。

たとえば、請求書額1,000万円を手数料率3％で30日早く資金化した場合、30万円が30日分のコストとなり、これを年率換算すると「1か月で3％＝1年で約36％」という高い数字になります。

この比較から、「ファクタリングは高いからダメ」という結論になりやすいのですが、実務では「その30日分をどう捉えるか」が重要です。

たとえば、その資金を使って確実に利益を生む案件を対応できる、支払遅延による信用低下や延滞利息を防げる、といった具体的なメリットと合わせて考える必要があります。

逆に、明確なリターンやリスク回避効果がない場面で短期的な資金繰りだけのために繰り返し利用すると、実質コストが重くのしかかってきます。

ファクタリング手数料の相場

ファクタリングの費用を検討するときは、「相場はいくらか」という単純な比較だけでなく、「どのスキームで・どの売掛先を・どの期間前倒しするか」によって手数料水準が変わることを理解しておく必要があります。

一般的に、売掛先への通知を行わない2社間ファクタリングはファクタリング会社のリスクが高く、手数料も高めになりやすい一方、売掛先に通知して直接支払ってもらう3社間ファクタリングは回収リスクが低く、手数料を抑えやすい傾向があります。

また、同じ2社間・3社間であっても、売掛先の信用力、請求書額、取引回数（スポットか継続か）、業種、前倒し日数などの条件によって実際の料率は大きく変動します。

そのため、「2社間は必ず◯％」「3社間は必ず◯％」という決め打ちではなく、「自社が置かれている条件から見ると、どのレンジに収まりそうか」を相場として把握しておくイメージが大切です。

2社間・3社間ファクタリングの手数料相場

2社間・3社間ファクタリングの相場をイメージするうえでは、「ファクタリング会社がどこまでリスクを取っているか」を軸に考えると整理しやすくなります。

2社間ファクタリングでは、売掛先への通知を行わず、利用者が従来どおり売掛金を回収し、その入金を原資にファクタリング会社へ支払いを行う形になるため、「売掛先の支払遅延」だけでなく「利用者側の資金繰り・管理リスク」もファクタリング会社が負うことになります。

このため、一般に手数料は3社間より高めに設定される傾向があります。

一方、3社間ファクタリングでは、売掛先に債権譲渡の通知・承諾を行い、売掛先がファクタリング会社へ直接支払うスキームであるため、回収ルートが明確で、二重譲渡などのリスクも抑えやすくなります。

その分、手数料率も2社間より低めに抑えやすいケースが多く、「コスト重視であれば3社間」「取引先に知られたくない場合は2社間」という使い分けが検討されます。

ただし、同じ2社間・3社間の中でも、売掛先が上場企業・大企業なのか、中小企業なのか、取引金額が数十万円規模か数千万円規模か、スポット利用か継続利用かなどで実際の料率は変わります。

見積りを取る際には、「自社の条件を伝えたうえで、2社間・3社間それぞれの見積りを出してもらう」という手順を踏むと、相場感を掴みやすくなります。

請求書額・日数別の費用計算シミュレーション

ファクタリング費用をより具体的にイメージするには、「請求書額」と「前倒しする日数」を決めてシミュレーションしてみることが有効です。ここでは、分かりやすい例として、2つのケースを想定します。

前提条件として、

・ケース1：請求書額300万円、手数料率5％、入金期日前30日を前倒し
・ケース2：請求書額1,000万円、手数料率3％、入金期日前60日を前倒し

とします（いずれも2社間・3社間を問わない、単純な計算例）。

ケース1では、手数料は300万円×5％＝15万円となり、入金額は300万円−15万円＝285万円です。30日間で15万円のコストを支払うイメージになります。

ケース2では、手数料は1,000万円×3％＝30万円となり、入金額は970万円です。60日間で30万円のコストということになります。

金額だけ見るとケース2の方が手数料総額は大きいですが、「請求書額に対する割合」と「前倒し日数」を合わせて見ると、負担感は異なります。

実務では、ここに事務手数料や登記費用などが加わるため、見積書を受け取った際には、「請求書額」「手数料率」「前倒し日数」「その他費用」を一覧にし、1件ごとの総コストを計算しておくと判断しやすくなります。

年率換算で見る実質コストの目安

ファクタリング手数料は一見すると「◯％だけ」と感じやすいですが、その前倒し期間が短いほど、年率に換算したときの実質コストは高くなります。大まかな目安として、単純化した計算式を用いると、

「実質年率 ≒ 手数料率 ×（365日 ÷ 前倒し日数）」
というイメージで把握できます（実際の利回り計算とは異なりますが、比較のための目安として）。

先ほどのケース1（手数料率5％、前倒し30日）にこの式を当てはめると、
5％×（365÷30）≒5％×約12.17≒約60.8％
となり、年率換算ではかなり高い数字になります。

ケース2（手数料率3％、前倒し60日）では、
3％×（365÷60）≒3％×約6.08≒約18.2％
程度のイメージになります。

この数字だけを見ると、ファクタリングは「金利よりはるかに高い」と感じやすいですが、実務では「その30日・60日で何を守れるか・生み出せるか」も合わせて考える必要があります。

遅延による信用低下や延滞利息の発生を防げるのであれば、その回避効果も含めて判断すべきです。

一方で、明確なメリットがない状態で繰り返し利用すると、年率換算したコストが積み上がり、利益を圧迫する結果につながります。

手数料以外でかかる実務上のコスト

ファクタリングの費用というと手数料率に目が行きがちですが、実務ではそれ以外のコストも合算されてはじめて「本当にいくらかかったか」が見えてきます。

代表的なものとして、債権譲渡登記に伴う登録免許税や司法書士報酬、契約書に貼付する印紙税、初回契約時の事務手数料、振込手数料や出張費などがあります。

これらは請求書額や手数料率とは別に加算されるため、「手数料3％のはずが、結果的に3.5〜4％相当になっていた」といったことが起こり得ます。

特に、継続利用を前提とした中小企業・個人事業主にとっては、毎回の振込手数料や事務手数料が年間を通してどの程度積み上がるのかを意識することが重要です。

費用を細かく分解しておくことで、「登記が不要な範囲で使う」「同じファクタリング会社との取引をまとめて事務コストを抑える」など、現実的なコスト削減策も検討しやすくなります。

債権譲渡登記・司法書士報酬・印紙代

一定額以上の取引や継続的な取引では、ファクタリング会社が債権譲渡登記を求めるケースがあります。債権譲渡登記とは、「どの債権を誰に譲渡したか」を法務局に登記し、第三者に対して優先的な権利を主張できるようにする手続きです。

この際に発生するのが、登録免許税（公租公課）と登記手続を依頼する司法書士への報酬です。登録免許税は登記の種類や金額に応じて一定の税額が定められており、司法書士報酬も数万円〜の単位でかかることが一般的です。

また、ファクタリング契約書や基本契約書には、印紙税法上の課税文書として印紙を貼付する必要が生じる場合があります。

契約の内容（売買契約に該当するか、金銭消費貸借に該当するかなど）によって課税区分が異なるため、契約書の種類ごとに税理士や司法書士等に確認しておくと安心です。

これらの費用は一見すると少額に見えますが、取引金額が大きい場合や登記を何度も行う場合には合計が無視できない水準になることもあります。

事務手数料・振込手数料・出張費など諸費用

ファクタリング会社との取引では、手数料以外に「事務手数料」や「振込手数料」「出張費」など、細かい諸費用が発生します。

事務手数料は、審査・契約書作成・システム登録などに対する定額費用として設定されることが多く、初回取引時のみ発生するパターンと、取引ごとに発生するパターンがあります。

振込手数料は、入金のたびに数百円〜数千円程度がかかるため、回数が多いと年間で無視できない額に膨らみます。

出張費は、ファクタリング会社の担当者が現地訪問や対面面談を行う際の交通費・日当として請求されることがあり、「地方の事業者で訪問必須」というケースでは特に注意が必要です。

また、郵送や書類の返送に関する実費、オンラインサービスであってもシステム利用料やオプション機能の料金がかかる場合があります。

これらの諸費用は、見積書や契約書の「備考」「その他費用」欄にまとめて書かれていることが多いため、手数料率と同じくらい丁寧に確認しておくことが大切です。

会計処理・消費税・経費算入上のポイント

ファクタリング費用を検討する際には、「会計上どの勘定科目になるか」「消費税の取り扱いはどうなるか」「法人税上の経費としてどこまで算入できるか」といった点も押さえる必要があります。

一般的に、ファクタリング手数料は「支払手数料」や「支払利息」「雑費」などの勘定科目で経費处理され、事務手数料・登記関連費用・司法書士報酬・印紙税なども、契約の性質に応じて経費として計上されるケースが多くなります。

ただし、どの勘定で処理するか、どの期間の費用とするかについては、個別の契約内容・会計方針に応じて税理士・会計士と相談するのが安全です。

消費税の面では、売掛債権の譲渡対価や割引料・ファクタリング手数料は原則として非課税取引とされる一方、別建ての事務手数料や司法書士報酬などは課税仕入として扱われるなど、取引内容ごとに取扱いが異なります。

印紙税についても、契約書の種類によって課税文書かどうかが変わるため、税務上の判断は専門家の確認が前提になります。

重要なのは、「ファクタリングの費用＝すべて損」と考えるのではなく、経費算入や消費税控除の可能性も含めて、実効負担を整理することです。

費用を抑えるためのファクタリング会社の選び方

ファクタリングの費用を抑えるためには、「どの会社を選ぶか」「どのような条件で申し込むか」が重要になります。

同じ請求書額・同じ売掛先でも、ファクタリング会社ごとに手数料率・事務手数料・登記費用の扱いが異なり、トータルコストに差が出ることが珍しくありません。

特に、初めて利用する中小企業・個人事業主は、「率だけを見て判断してしまう」「他社と比較しないまま契約してしまう」といったパターンに陥りがちです。

会社選びの際は、①手数料の決まり方（2社間か3社間か、売掛先の信用力・業種・金額など）、②見積書の内訳表示がどれだけ明確か、③追加費用や例外条件の書き方が分かりやすいか、④契約前の説明や相談対応の丁寧さ、といった観点で比較することがポイントになります。

また、複数社から見積を取り、「請求書額◯円・前倒し◯日」という同じ前提で並べて比較することで、「相場から大きく外れた高コスト条件」を見抜きやすくなります。

• 1社だけでなく、少なくとも2〜3社から条件を取り寄せる
• 「手数料率」「その他費用」「入金額」を同じ前提で比較する
• 安さだけでなく、説明の丁寧さや対応スピードも評価軸にする

手数料が決まる主な要因と交渉余地

ファクタリングの手数料は、単に「会社ごとの設定」だけでなく、案件ごとのリスクや事務負担によって決まります。

主な要因としては、①スキーム（2社間か3社間か）、②売掛先の信用力（上場企業・大企業か、中小企業か）、③取引金額（少額か、大口か）、④利用頻度（スポットか、継続か）、⑤業種（回収リスクの高低）、⑥前倒し日数（どれだけ早く資金化するか）などがあります。

これらの要因を整理して伝えることで、同じ案件でも手数料に差が出ることがあります。

交渉余地が生じやすいのは、「売掛先が安定している」「継続的な利用を見込める」「請求書額が一定規模以上である」といった条件です。

たとえば、毎月同じ売掛先に対する請求が発生している場合、その実績を示し「継続取引を前提に手数料率を下げられないか」を相談することで、スポット利用より有利な条件が提示される余地があります。

一方で、売掛先の信用力が低い、回収リスクが高い業種、初回かつスポット利用といった場合は、手数料を大幅に下げる余地は小さくなります。

見積書でチェックしたい費用表示・注意点

見積書の段階で費用表示を丁寧にチェックすることが、結果的にファクタリング費用を抑える近道になります。

ポイントは、「目立つ場所に書かれている手数料率」だけでなく、「備考欄や小さな注記に書かれている追加費用・条件」を見落とさないことです。

具体的には、①手数料率の範囲（〜％〜〜％）、②事務手数料の有無と金額、③登記費用や司法書士報酬の扱い（実費別途か、込みか）、④振込手数料・出張費などの諸費用、⑤不払い時の追加費用・違約金の有無と内容、などを確認します。

また、「◯％〜」と幅が書かれている場合は、「今回の見積では何％を適用しているのか」「どの条件で上限に近づくのか」を必ず質問しておくべきです。

将来条件が悪化した際に手数料が自動的に上がる仕組みになっていないかも確認ポイントです。複数社の見積書を同じフォーマット（請求書額・手数料・その他費用・入金額）で一覧表にまとめると、比較が容易になります。

高コスト・偽装ファクタリングを避ける

市場には、ファクタリングの形を取りながら実質的には高金利の短期融資に近いスキームや、名目上の手数料は低く見せつつ、各種名目で費用を積み上げる高コストなサービスも存在します。

こうした「偽装ファクタリング」や過度に高い費用の取引を避けるためには、相場感とチェックリストの両方を持つことが有効です。

たとえば、手数料率が二桁台後半〜二十数％に達している、前倒し期間が短いにもかかわらず年率換算で極端に高い、登記・司法書士報酬とは別に不明瞭な「コンサル料」「調査費」などが設定されている、といった場合は慎重な検討が必要です。

また、「審査ほぼ不要」「売掛がなくても利用可能」「契約書の内容は後で説明する」といった勧誘は、条件が利用者に著しく不利な可能性があるため、まずは契約書・見積書を持ち帰り、第三者の目で確認してもらうことが望まれます。

他の資金調達手段との費用比較と使い分け

ファクタリングの費用が高いかどうかを判断するには、単独ではなく「他の資金調達手段と比べてどうか」という視点が欠かせません。

代表的な比較対象は、銀行融資（証書貸付・当座貸越・手形貸付など）やビジネスローン（ノンバンクの事業者向けローン）です。

銀行融資は、金利が年率数％台に抑えられる場合が多い一方で、審査に時間がかかり、担保や保証人を求められることも少なくありません。

ビジネスローンはスピードを重視できるものの、金利がやや高めに設定される傾向があります。

ファクタリングは、「売掛先の信用力を活用して短期で資金化」「原則として負債を増やさずに資金繰りを改善できる可能性がある」という点で他手段と性格が異なります。

そのため、銀行融資が取れるなら融資で賄うべき場面もあれば、融資では対応しきれない短期の資金ギャップにファクタリングを組み合わせる方が合理的な場面もあります。

重要なのは、費用だけでなく「期間」「スピード」「財務への影響」「担保・保証の要否」を含めて総合的に比較することです。

• 銀行融資：低金利・長期だが、審査に時間と要件が必要
• ビジネスローン：審査は早いが、金利は銀行より高め
• ファクタリング：短期の資金化に強いが、年率換算では高コストになりやすい

銀行融資・ビジネスローンとのコスト比較

銀行融資とビジネスローン、ファクタリングをコスト面で比較する際には、「年率換算で見たときの水準」と「必要な期間」の両方を考慮する必要があります。

銀行融資（証書貸付）は、担保や保証人が必要になることもありますが、金利は年率数％台に収まるケースが多く、長期にわたって安定した資金ソースとなります。

ビジネスローンは、銀行融資よりも高い金利（年率数％〜十数％台）になることがありますが、審査が早く、担保・保証人なしで利用できる商品も存在します。

ファクタリングは、先述の通り、年率換算すると高い数字になることが多いものの、実際に前倒しする期間は30〜60日程度と短い場合が大半です。

そのため、「どうしても明日・明後日までに資金が必要」「銀行融資の審査を待っている余裕がない」といった場面では、ファクタリングが現実的な選択肢になることがあります。

一方で、「半年〜1年程度の資金繰りを安定させたい」という場合には、銀行融資やビジネスローンの方がトータルのコストを抑えやすいケースが多くなります。

短期資金と中長期資金での費用バランス

資金調達の費用を抑えるには、「短期資金」と「中長期資金」をきちんと区分し、それぞれに適した手段を選ぶことが大切です。

短期資金（数週間〜数か月程度）は、売掛金の入金と支払いのタイミングのズレを埋める目的が多く、ファクタリングや短期借入を用いるケースが一般的です。

ここでは、多少コストが高くても、スピードと確実性を重視せざるを得ない場面もあります。

これに対して、中長期資金（数年単位の運転資金や設備投資資金）は、銀行の証書貸付や資産担保融資、公的な制度融資など、年率数％台の融資で対応するのが基本です。

この部分を短期の高コスト資金で賄おうとすると、返済・支払負担が重くなり、再度の資金調達を呼び込む悪循環に陥りやすくなります。

したがって、ファクタリングの費用を抑えるという観点でも、「本来中長期資金で賄うべき部分までファクタリングに頼っていないか」を定期的に点検することが重要です。

資金繰り表をつくり、どの支出をどの資金調達手段で賄っているかを整理しておくと、費用バランスの偏りに気づきやすくなります。

中小企業・個人事業主が費用を抑えるコツ

最終的にファクタリング費用を抑える鍵は、「単発の条件交渉」よりも、「資金調達全体をどう設計するか」にあります。

具体的には、①複数社から見積を取り、条件を比較する習慣をつける、②ファクタリングの利用を特定の場面（大口案件・繁忙期など）に限定する、③売掛先との取引条件（支払サイト・回収条件）の見直しを検討する、④在庫圧縮やコスト削減などで必要運転資金そのものを減らす、といった取り組みが有効です。

また、顧問税理士や取引銀行と定期的に情報交換を行い、「今後1年〜3年の資金計画」を共有しておくことで、「あの時、別の制度融資が使えた」「このタイミングなら金利条件を見直せた」といった機会損失を減らすことができます。

ファクタリングを上手に使っている企業ほど、「緊急時に絞って使う」「条件が悪化しそうなときは早めに他の手段に切り替える」といったルールを社内で決めているケースが多いです。

まとめ

ファクタリング費用は「手数料率◯％」だけでなく、前倒し日数・登記費用・各種事務手数料まで含めたトータルコストで見ることが重要です。

2社間はスピードと秘匿性の代わりに手数料が高め、3社間は売掛先への通知が前提になる代わりに費用を抑えやすいなど、スキームごとの特徴も踏まえて比較する必要があります。

本記事で整理した計算イメージ・チェックリスト・他手段との比較軸を使えば、相場から外れた高コスト案件を見抜きつつ、自社の資金ニーズに合った使い方がしやすくなります。

複数社から見積りを取り、条件と費用を数値で比較する習慣を持つことが、結果的にファクタリング費用を抑える近道といえます。